Территориальный орган Росздравнадзора по Ставропольскому краю организован в 2004 г.
Структура федеральных органов исполнительной власти утверждена Указом Президента № 649 от 20 мая 2004 г. Положение о Федеральной службе в сфере здравоохранения и социального развития утверждено Постановлением Правительства № 323 от 30 июня 2004 г. 22 ноября 2004 г. Приказом Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации № 205 было утверждено «Положение о территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития по субъекту Российской Федерации».
На сегодня штатная численность Территориального органа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Ставропольскому краю составляет 23 человека. Укомплектованность штатов 23 единицы.
Основные полномочия Территориального органа Росздравнадзора по Ставропольскому краю - надзор в сфере здравоохранения, за фармацевтической деятельностью, а также лицензирование медицинской и фармацевтической деятельности и деятельности, связанной с оборотом наркотических средств и психотропных веществ, внесенных в список II и список III и пр.